须与结核性溃疡、梅毒溃疡、软下疳和上皮癌等溃疡相鉴别。其中溃疡性结肠炎和肉芽肿性结肠炎并发之肛裂极易鉴别。
1.肛门皮肤擦伤肛裂早期需与肛门皮肤擦伤相鉴别。
2.肠道炎性疾病某些肠道炎性疾病可伴有肛门周围的溃疡，诊断时应注意鉴别裂口呈陈旧性溃疡，合并肛乳头肥大及哨兵痔，或伴有皮下瘘管及肛隐窝炎症等。
①肛管结核溃疡;
②克罗恩病肛管溃疡;
③梅毒溃疡;
④溃疡性结肠炎并发的肛裂。
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