诊断主要结合流行病学史、临床表现和病原学检查，早发现、早诊断是防控与有效治疗的关键。
(一)疑似病例
符合下列情况之一即可诊断为疑似病例：
1.发病前7天内与传染期甲型H1N1流感确诊病例有密切接触，并出现流感样临床表现。密切接触是指在未采取有效防护的情况下，诊治、照看传染期甲型H1N1流感患者;与患者共同生活;接触过患者的呼吸道分泌物、体液等。
2.发病前7天内曾到过甲型H1N1流感流行(出现病毒的持续人间传播和基于社区水平的流行和暴发)的地区，出现流感样临床表现。
3.出现流感样临床表现，甲型流感病毒检测阳性，尚未进一步检测病毒亚型。
对上述3种情况，在条件允许的情况下，可安排甲型H1N1流感病原学检查。
(二)临床诊断病例
仅限于以下情况作出临床诊断：同一起甲型H1N1流感暴发疫情中，未经实验室确诊的流感样症状病例，在排除其他致流感样症状疾病时，可诊断为临床诊断病例。
甲型H1N1流感暴发是指一个地区或单位短时间出现异常增多的流感样病例，经实验室检测确认为甲型H1N1流感疫情。
在条件允许的情况下，临床诊断病例可安排病原学检查。
(三)确诊病例
出现流感样临床表现，同时有以下一种或几种实验室检测结果：
1.甲型H1N1流感病毒核酸检测阳性(可采用real-timeRT-PCR和RT-PCR方法)。
2.分离到甲型H1N1流感病毒。
3.双份血清甲型H1N1流感病毒的特异性抗体水平呈4倍或4倍以上升高。
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