多数疣患者在发病1～2年内自行消退，不少患者即使采用深度破坏性方法，有1/3疣仍复发，因此需慎重选择，对一些能造成长期性瘢痕的疗法，不宜使用。
1.药物治疗
(1)氟尿嘧啶软膏;
(2)博莱霉素皮损内注射;
(3)0.7%斑蟊素;
(4)0.1%～0.3%维A酸酒精溶液;
(5)3%酞乙胺软膏或3%酞乙胺二甲基亚砜搽剂;
(6)0.5%鬼臼毒素;
(7)5%咪喹莫特霜;
(8)抗病毒药;
(9)其他，水杨酸，普鲁卡因等均有报道。干扰素、转移因子、胸腺肽等免疫增强剂，全身或疣体注射。
2.光动力学疗法
系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣、尖锐湿疣。
3.物理疗法
冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。
4.手术切除
个别巨大疣体可行手术切除术。
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