心脏瓣膜病的病因有先天性及后天性两类。
先天性：即出生时已发现瓣膜病变，如部分病人主动脉瓣只有两叶，比正常少了一叶，病变的主动脉瓣开放不全，影响血液流通。
后天性：大致有感染、退化及其它疾病引发。
A.感染：细菌通过血液到达心脏内部并侵犯瓣膜。使用静脉注射的吸毒者以及瓣膜原先已有问题者(较厚或钙化)容易发生。
B.退化：随年龄渐长，瓣膜会逐渐退化，以主动脉瓣最常见。
C.其它：主要指风湿性心脏病。由于链球菌感染，继而引发免疫反应而破坏心脏瓣膜。
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