眼部感染的潜伏期较长，病程发展较慢，临床诊断依靠病史及眼部体征，确诊须靠真菌检。
可采用组织病理学、脱落细胞学、免疫荧光技术、电镜观察、核酸杂交和聚合酶链反应等直接检查病变标本中是否存在病毒颗粒或特异性抗原。微生物学检査等等。
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