湿疣是很顽固的疾病之一，此疾病的传染性非常强，传播的途径有很多种，而且容易反复发作。这就给治疗湿疣带来了很多困难。治疗湿疣就应该知道病因，才能对症下药。下面是湿疣的复发原因。
1、对于病人来说，感染湿疣可能存在有3种不同的状态，即肉眼可见向外生长的疣组织;肉眼不能见，只能在显微镜下才能见到有病变的亚临床感染;尚未出现病变，但组织表面携带有病毒，只能用分子杂交技术如多聚酶链反应法才能测出病毒。临床治疗时，医生只能清除掉肉眼能看见的那部分疣组织，其他湿疣感染状态在治疗后的一段时间里发展成肉眼能见的疣组织。女性生殖道对病征具有隐蔽性的特点，没有得到及时的诊断，往往会长期忍受病痛之苦，造成湿疣的泛发，如不彻底治疗，危害更大。
2、湿疣的病变过程主要发生在上皮组织内，病毒也只局限于上皮组织层内，人体皮肤黏膜的免疫系统存在于上皮下的真皮层内，由于上皮组织的基底层的阻隔，真皮内免疫系统不能与表皮内湿疣病-毒颗粒接触而建立起有效的免疫应答反应，因而使得湿疣久治不愈，这种情况同样见于青年人面部的扁平疣及手上的寻常疣。
3、再感染，夫妻一方治愈了，而另一方是亚临床感染或病毒携带者，通过性生活又可被传染上，医学上叫作“打乒乓球”状态，导致反复感染。
4、免疫功能低下的人群发病和复发的几率高，如恶性肿瘤、红斑狼疮、肾移植、化疗、应用糖皮质激素者，湿疣发病和复发的几率成倍增加，且疣体也大。
5、婚姻状况与湿疣的复发和发病有关。男性离婚，夫妻分居，丧偶和未婚者，夫妻生活不协调者，由于增加了高危性行为，复发几率也增多。性生活中选择避孕套措施不当，也会导致湿疣的复发和发病机会。
6、其他性传播疾病也会引起湿疣的复发。如生殖器疱疹、淋病、滴虫、梅素、HIV、真菌感染等，通过破坏黏膜屏障，使抵御该病感染的能力下降，并且使生殖器局部环境变得潮湿，有利于病毒的繁殖生长，增加了湿疣的复发的几率。
