引起凹甲的原因有很多，比如有甲营养不良，缺乏维生素或微量元素也会引起指甲变形，凹甲的病因尚未明确。凹甲呈一定的流行及地主性，临床表现有发热、皮疹等，推测与感染有关。一般认为可能是多种病原，包括EB病毒、逆转录病毒(retrovirus)，或链球菌、丙酸杆菌感染。指甲，是人和猿猴类指(趾)端背面扁平的甲状结构，属于结缔组织。指甲受到伤害会引起变形，主要病因有以下几种：
1、全甲营养不良型甲癣
这并不多见，常为以上各型最终发展的结果。表现为全甲失去光泽、变质、增厚或碎裂、脱落后留下异常增厚的甲床。
2、慢性皮肤粘膜念珠菌性甲型(或真性念珠菌甲癣)甲癣
表现为全甲变质、膨起、松脆，表面疣状，凹凸不平。
3、慢性甲沟炎型甲癣
表现为外侧甲皱襞及近端甲皱、表皮护膜变质或变棕色。最重要的特点是有甲沟炎存在，甲周皱襞肿胀而没有甲下角化过度，可有少量渗液但从不出脓。此型亦多由念珠菌引起。
