祖国医学对疱疹病毒的诊治独辟蹊径，根据人体气血津液阴阳平衡的辨证观点，运用“五脏病机”和“六腑病机”学说，认为本病皆因欲念外动，相火炽盛，内被七情所累，外感六淫所侵，针对于此使用不同方剂：
(1)肝胆湿热型
肝主疏泄功能失司，泄而不畅，胆助肝之疏泄，次调畅气机，然肝胆不和至使热毒不去，湿热内生，聚于膀胱，下注阴部而发疱疹。患者心烦灼热，大便干结，脉弦滑数，舌红苔黄，疹易破溃糜烂，治则清热利湿解毒，凉血泻火，清泄肝胆，方用0号汤剂。
(2)阴虚内热型
疱疹群集湿红成片，破溃后形成溃疡或破溃后缓慢结痂，患者咽干唇燥，口渴引饮，舌红苔剥，脉细数，如此时大量使用西医抗病毒和免疫调节药品，只能暂时压制病毒，从而导致延长病程，错失最佳治疗时机。中医辨证认为，此证属阴虚火旺，肝肾两虚，由于用药不当或过食肥甘辛煎炸刺激食品，造成内热蓄积、热伤津液，上蒸于口鼻，下灼于阴部，致使阴阳失衡，精血、津液等物质亏耗，无法满足正常生命需求。治疗应养阴生津，清热利湿解毒，方用1号汤剂。
(3)气阴两虚型
反复发作，迁延不愈，患者体能下降，身心疲惫，皆因未得到及时科学的治疗，患者多有少气、懒言、疲倦乏力、口渴喜饮、心烦、小便短赤，脉细数舌质红、苔少，患者对西医治疗已无信心。中医辨证认为，母子两虚，气不载血，阴不制阳，治疗应为益气生津养阴，扶正固本，方用2号汤剂。
