稽留流产系指胚胎死亡而仍稽留于宫腔内者，且孕产物一般多在症状产生后1～2个月内排出。因此，皆规定胚胎停止发育后2个月尚未自然排出者，称为稽留流产。稽留流产的病因多来自先天因素，具体的先天性病因有：
1.胚胎先天性异常：
大约有60%的早期流产属于这种原因。引起胚胎先天性异常的原因较多，如遗传病、孕期病毒感染、孕期食物或化学品中毒等。有人称，流产是人类在大自然的条件下的汰劣存优过程，看来有一定的道理。
2.遗传因素：
由染色体的数目或结构异常所致的胚胎发育不良，是流产最常见的病因，尤其是怀孕头3个月以内的流产，染色体异常者占50%一60%。
3.母体疾患：
母亲的体质差或患有严重的疾病，如急性传染病，严重的贫血和营养不良，生殖道畸形和生殖器官肿瘤，内分泌功能失调，母子血型不合等，均可危及胎儿导致流产。
4.父方因素：
近年发现一种无症状的茁精症可导致流产。研究结果显示，10%一15%的男性精液中含有一定数量的细菌，会影响孕妇，使胚胎流产。
