输卵管发育或功能异常输卵管发育异常如输卵管过长，肌层发育不良，粘膜纤毛缺如，双管输卵管，额外伞部等，均可成为异位妊娠的原因。输卵管的生理功能复杂，输卵管壁的蠕动，纤毛活动以及上皮细胞的分泌均受雌，孕激素的调节，如两种激素之间平衡失调，将会影响孕卵的运送而发生异位妊娠。
输卵管手术后输卵管绝育术不论采用结扎，电凝或环套法，如形成输卵管瘘管或再通，均有导致异位妊娠的可能，输卵管绝育后复通术或输卵管成形术，亦可因疤痕使管腔狭窄，通畅不良而致病。
盆腔子宫内膜异位症引起的异位妊娠，主要是由于机械因素所致，此外，异位于盆腔的子宫内膜，对孕卵可能有趋化作用，促使其在宫腔外着床。
