有充分证据显示，孤独症学生与家庭背景和父母教养的态度无关，亦不是因后天环境造成。孤独症可能是由生理因素形成，如神经机能发展、生化机能发展、遗传因素或脑部受损所致。孤独症可能是由生理因素形成，如神经机能发展、生化机能发展、遗传因素或脑部受损所致。
可能导致孤独症的成因包括：
1、遗传：
从家族和挛生子的研究中，发现孤独症人士的挛生兄弟姊妹大约有10%至20%可能有轻微的自闭倾向。从家族和挛生子的研究中，发现孤独症人士的挛生兄弟姊妹大约有10%至20%可能有轻微的自闭倾向。
2、受疾病感染：
妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致孤独症。此外，新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成孤独症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产、难产、新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎、脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患孤独症的机会。
