面神经瘫痪的发病机制至今尚未完全阐明。由于骨性面神经管仅能容纳面神经通过，面神经一旦发生炎性水肿，必然导致面神经受压。风寒、病毒感染(如带状疱疹)和自主神经功能不稳等，可引起局部神经营养血管痉挛，最终导致面神经瘫痪的发生。
目前多认为面神经瘫痪主要由病毒引起，病毒在体内如何损伤面神经目前尚不完全清楚，单纯性疱疹病毒可能是面神经瘫痪的重要病因，单纯性疱疹病毒在人体病理生理的其他方面了解的比较清楚，由此可以推测面神经瘫痪的病理生理机制。
病毒潜伏在三叉神经节，其他脑神经如膝神经节和脊神经感觉神经节，经过并不清楚的方式病毒被激活，在神经节内复制，并避开了循环抗体的攻击，病毒复制中对神经节的损伤引起神经功能降低，临床上出现面部，咽部，头部和颈部的感觉迟钝，然后病毒进入到轴突，引起脊神经根炎，并上行到脑干引起局部脑膜脑炎，这种变化可由脑脊液蛋白增高和淋巴细胞增多证明，此炎症反应通过Gadolinium增强的MRI检查亦可以看到。
在受累的神经中病毒感染了Schwann细胞引起炎症反应，病毒积聚在 神经细胞的纤维蛋白鞘内，当病毒经细胞膜破出时，出现神经细胞膜受损的自身免疫反应，导致髓磷脂断裂，脱髓鞘和面神经核细胞的染色质溶解，然后淋巴细胞浸 润周围神经纤维，在炎症和自身免疫反应消除后，这些神经细胞虽然受损，但可以修复，重新形成髓鞘，神经肌肉功能恢复的程度取决于损伤的程度。
