生殖器疱疹治疗方法有很多，最主要的是抗HSV治疗，目前仅有阿昔洛韦一种药确定有效，而其他药物尚在考察阶段。6～8岁或一年复发6次以上(含6次)的患者可考虑用免疫抑制治疗。物理治疗He—Ne激光照射，可促进病灶愈合，缩短病程。常用的一些中药外洗方或外治方，可以减轻生殖器疱疹的疼痛和症状。如果是孕妇，如无威胁母体生命的严重生殖器疱疹感染，最好不要全身用药。对新生儿的处理可于分娩后立即注射丙种球蛋白以预防感染。
生殖器疱疹的预防有其自身的特点，主要强调健康教育。强调病人将病情告知其性伴，取得性伴的谅解和合作，避免在复发前驱症状或皮损出现时发生性接触，或更好地采用屏障式避孕措施，以减少HSV传染给性伴的危险性;提倡安全套等屏障式避孕措施，安全套可减少生殖器疱疹传播的危险性，但皮损出现时性交，即使使用安全套也可能发生HSV性传播;改变性行为方式，避免非婚性行为，杜绝多性伴，是预防生殖器疱疹的根本措施。
来源资料：《中国皮肤性病学杂志》 2000年 第1期