性交疼痛的性治疗即指心理治疗和行为治疗，是女性性功能治疗必不可免的治疗方法，性治疗在西方已较普及，许多夫妻能自行处理和解决他们的程度较轻的性功能障碍，所以目前临床上所见到的性功能障碍要比十几或二十几年前复杂得多，但在国内，许多夫妻缺乏最基本的性知识，遇到问题又讳疾忌医，结果只能长期默默忍受疾病的折磨。
治疗首先应指导他们学习性知识及性技巧，使女性知道阴道上有许多皱褶，阴道有很强的伸展性，可以容纳任何大小的阴茎，甚至在生孩子时可以通过胎儿，所以不必为男子阴茎的大小而担忧，使男性知道，女性在性交前需要由男性的亲吻，爱抚等准备活动来激发女性的性冲动，才能使阴道变得润滑，使阴茎易于插入，在性活动中男方切忌强行，粗暴地插入阴茎，最好由女方将阴茎纳入阴道。
充分认识到性和谐和性相容的重要性，告诉病人心理因素在性反应中的重要影响，性活动是双方的协调活动，与双方的情绪和情感有密切关系，如果女方情绪不佳，不想参加性活动或夫妻感情不和时，最好避免性活动，虽然大多数情况下它还不会造成严重疼痛，如果一旦同时存在某种局部疾患，过度焦虑之类的心理因素，或既往遭受过消极的或痛苦的经历，或近期遭遇重大心理创伤如痛失亲人时，过早过深地插入或强行性交便会给妇女带来疼痛和心理伤害，也可以说先有致痛的疾患或消极的经历，然后对所发生的问题逐渐失去控制，性反应减弱，焦虑则不断加重，最后形成恶性循环，一般说来器质性因素常使疼痛集中在某个固定的区域，而心理因素造成的疼痛则具有游走性和时轻时重的特点，当然，心因性疼痛点也可能固定，需要注意鉴别，认知疗法：对患者进行正确的性教育，改变她们关于性的不合理理念，建立正确的性观念：性是正常的生理及心理需要，性是夫妻生活中非常重要的一环，是男女双方的事，明白夫妻感情在性活动中的重要意义，懂得性生活对人类的真正价值和意义，性交时能密切配合，共同享受性生活的乐趣，是生殖健康赋予她们的权利。
行为治疗：主要包括性感集中训练，凯格尔训练等系统脱敏疗法等，若病人自己在性交开始时先限制阴茎的插入或过深的插入，有助于缓解和减轻性交疼痛的发生，这就提示病人可能存在心理方面或婚姻关系方面的其他问题的可能性，它们的影响可单独存在，也可叠加于已存在的器质性因素上，除治疗器质性疾病外，应安排性感集中训练等行为治疗以求解决并存的其他问题。
治疗应最大限度地减少并发的器质性因素，如使用包括局部麻醉剂在内的使交感神经紧张释放缓解的药物，一旦获得一定程度的舒适与缓解，就可以采用治疗阴道痉挛时经常用的阴道松弛训练方法：让病人在充分松弛的情况下向阴道内插入手指的做法，如果插入导致不适或疼痛，就停止下来继续放松，然后再插入，如果训练很顺利，可尝试插入2指或3指，直至真正性交时也不会引起疼痛为止。
近来采用音乐疗法配合心理疏导治疗原发性性交疼痛取得良好效果，患者均为初次性交即出现剧烈疼痛，并在以后的性交中经常反复发作;疼痛可在外阴部及阴道口周围，也可在阴道深部，患者恐惧，焦虑心理较严重，妇检均为后位子宫，生殖器官经检查均无畸形或异常。
针对患者的心理情况，以定期心理疏导为主，同时嘱其在每次性交之前放送其熟悉喜爱的轻音乐以进入放松状态，如果仍有疼痛不要强行，以欣赏音乐的方式结束，心理疏导的实施在首次检查时，先与她们谈心，取得她们信赖后，嘱其在放松的情况下妇检，先用一指检查，向她们介绍检查时的感受，可能有疼痛，告知配合方法，反复强调其生殖器官是正常的，以减轻其忧惧心理，增强对疼痛的承受力，然后用二指轻缓地将阴道扩张2～3指宽，维持数分钟后结束，如疼痛难忍即结束，以后每周复查1次，均在谈心，了解其回家的状况后行妇检，均指扩阴道2～3cm并维持数分钟后结束，同时，随时电话心理咨询。
Nappi等认为电刺激疗法能有效治疗性交疼痛，方法为对女性性交疼痛患者进行前庭及阴道外口的电刺激治疗，治疗后盆底肌肉收缩及静息活性明显提高，对电流强度的耐受性也显著提高，疼痛明显减轻而女性性功能指数(FSFI)明显提高，且部分阴道痉挛妇女治疗后能恢复正常性活动。
