依泌尿男生殖系真菌感染的病史、典型临床表现及实验室检查诊断不难，常用的实验室检查包括：
1.泌尿男生殖系真菌感染的镜检：5%～10%NaOH或KOH为载液，直接观察形态，区别真菌形态，但阴性不能排除诊断。肾念珠菌病也可进行肾活检，在染色的组织切片上发现典型的念珠菌芽孢或菌丝具有诊断意义。
2.泌尿男生殖系真菌感染的培养法：一般用简易培养法，念珠菌性龟头包皮炎用棉签涂抹包皮内板及冠状沟处分泌物，下尿路念珠菌病及肾念珠菌病取中段尿进行真菌培养，所有怀疑播散性念珠菌病患者都要进行血培养，培养基大多用Sabouraud's agar。
3.泌尿男生殖系真菌感染的血清学试验：可做念珠菌抗体检测，但对一次阳性结果无诊断意义，应对一段时间内定期获得的血清标本检测，抗体滴度高或滴度逐 渐升高有一定诊断意义。近年来，在一些专业的实验室内采用免疫印迹法可进行一些念珠菌抗原(如一种烯醇酶的48-KDa抗原和一个90-Kda热休克蛋白产物47-KDa抗原)检测。
