肥胖症确定后可结合病史、体片及实验室资料等，鉴别属单纯性抑继发性肥胖症。如有高血压、向心性肥胖、紫纹、闭经等伴24小时尿17羟类固醇偏高者，则应考虑为皮质醇增多症，代谢率偏低者宜进一步检查T3、T4及TSH等甲状腺功能试验。此外，常须注意有否糖尿病、冠心病、动脉粥样硬化、痛风、胆石症等伴随病。
早期轻、中度单纯性肥胖症患者实验室检查项目很少发生变化。伴随着肥胖症状的加重和患病时间的延长，患者可能会出现高胰岛素血症、高脂血症的情况;当肥胖症患者并发各种并发症时，患者则会出现相应的实验室检查结果异常的表现。如并发心血管疾病时，心电图或B超检查可以发现患者有左心室肥厚、心肌劳损的情况;并发呼吸系统疾病时，患者可出现高碳酸血症的症状;并发症糖尿病时，患者可以出现血糖水平升高、尿糖阳性等一系列表现。
肥胖症的常用检查项目如下：
1. 血脂检查：包括胆固醇、三酰甘油(甘油三酯)、高密度脂蛋白测定。
2.血糖检查：包括葡萄糖耐量试验，血胰岛素测定。
3.脂肪肝检查：B超、SGPT。
4.水代谢检查：抗利尿激素测定。
5.性激素测定：雌二醇、睾酮、FSH、LH。
6.检查血皮质醇、T3、T4、TSH等，用以除外间脑性、垂体性、肾上腺皮质功能、甲状腺功能和自主神经紊乱等。
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