发生胆道梗阻的病理原因主要是胆管的化脓性炎症向四周蔓延，向胆囊和肝外胆管周围蔓延，可引起脓性渗出和粘连。向肝内胆管周围蔓延，则引起胆管炎性化脓性肝炎和肝脓肿。
脓肿或小胆管破裂可以引起弥漫性腹膜炎或肝周围局限性脓肿，如膈下或肝下脓肿，并可因而引起反应性的胸腔或心包积液，脓肿也可破入支气管或心包。胆管周围炎侵蚀门静脉或肝动脉，可引起胆道出血、胆道梗阻。当然含菌的胆汁也可沿此途径进入血流，这可说明急性化脓性胆管炎的病人常迅速出现感染性休克，并易发生败血症的原因。如果在出现致命的后果之前，梗阻得以解除，炎性渗出物和坏死组织被吸收机化，胆囊和胆总管壁增厚并与周围器官粘连，也可引起或加重胆管狭窄，致使胆道的梗阻和感染容易复发，使上述病变重演。
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