呼吸困难一般是由于心血管系统和呼吸系统紊乱造成的，神经系统、运动系统、内分泌系统或造血系统出现异常亦有可能造成呼吸困难。呼吸困难的诊断除了了解病史外，还需进行辅助检查方可确诊。
1、血检
许多实验室也可以为检查造成呼吸困难的病因提供帮助。例如采用D-二聚体进行检测，可以通过阴性的D-二聚体值结果将肺栓塞排除以避免不必要的抗凝治疗，但如果结果呈阳性，那么采用D-二聚体进行检测就没有太大的帮助了。
类似的，进行血检时若脑钠素含量较低，则可以排除充血性心力衰竭，若检测出较高的含量，则可能会干扰诊断结果，因为造成脑钠素含量高的原因还包括高龄、肾衰竭、急性冠状动脉综合征或大面积肺栓塞等。
2、成像检查
采用X光进行胸透检查可以用来确诊或者排除气胸、肺水肿或肺炎，通过螺旋CT进行静脉造影可以对肺栓塞的诊断起到帮助。
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