如果肠道功能良好，营养支持的方法决定于硒缺乏病人是否能经口摄食。如果不能经口摄食，胃管的喂养应考虑，如伴有胃、食管反流、昏迷或其他神经损伤则可能需要鼻 饲管。如果管道喂养需要长于2个月或管道喂养作为最大的营养传递方式，应考虑采用胃造口术。
连续滴灌喂养有增加细菌生长的危险。应用的营养液的种类依赖于 硒缺乏病人的胃肠道功能，如功能良好则全蛋白、长链脂肪和复杂碳水化合物都可用，也可根据病人肠道吸收量和需要特别设计，根据小儿的大便情况决定这些硒成分是 否合适。但硒的刺激对营养不良性肠道损伤的恢复是必须的。硒缺乏和感染的关系密不可分，最常见的是患胃肠道、呼吸和/或皮肤感染，败血症也很多见。均需要用适当的抗生素治疗(但要防止滥用抗生素造成菌群失调)，由于营养不良儿经胃肠道的药物吸收可能不理想，因此普遍主张肠道外给药。
