菌尿是指清洁外阴后在无菌技术下采集的中尿标本，如涂片每个高倍镜视野均可见到细菌，或者培养菌落计数超过100000每毫升。通常情况下，尿液是无菌的，但是尿道口周围及尿道的下1/3是有菌的。因此，从人体排出的尿液可以沾染上一部分细菌。专家指出，菌尿是对人体伤害非常大的一种症状，患者在治疗菌尿前需要进行全方位的检查，这样才能及时确诊该症。
常用的方法有：
①尿沉渣涂片找细菌：可以初步确定尿路感染是阳性球菌还是阴性杆菌感染，作为使用抗菌药物的参考。清晨第1次新鲜中段尿沉渣涂片，每高倍镜视野下细菌数<10个或无细菌，则通常中段尿培养阴性或菌落计数<103/mL;细菌数达15～20个则中段尿培养菌落数>105/mL。
②尿液细菌培养：目前应用中段尿培养菌落计数的方法可以鉴别是否系尿路感染。<104/mL认为无意义或污染，菌落数>105/mL可作为尿路感染诊断的根据，当菌落数104～105/mL为可疑。尿培养的常见微生物有致病菌、少见的不肯定的致病菌和污染菌三大类。
③结核菌检查：为确定有无泌尿系结核的重要方法。尿液浓缩涂片抗酸染色找结核菌，104～105/mL为阳性，但阳性率低。
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